在對湖泊治理進行生物操縱管理之前，應(yīng)該對所用的方法進行理論和應(yīng)用方面的評價，建立適當(dāng)?shù)墓芾碓O(shè)施和組織，并以實現(xiàn)管理目標(biāo)為基礎(chǔ)制定出詳細(xì)的工作計劃。生物操控規(guī)劃階段還應(yīng)詳盡地征求所有者和公眾的意見。此外，應(yīng)防止肉食性魚類和其他有價值的物種從未管理區(qū)遷徒進入管理區(qū)，這一點對于管理規(guī)劃十分關(guān)鍵。對于一些需削減魚群的湖泊，還應(yīng)做好必要的準(zhǔn)備工作，包括捕撈、運輸和最終使用歸宿等。對于小型湖泊而言, 當(dāng)?shù)鼐用竦膮⑴c比較重要；對于大型湖泊而言，其管理規(guī)劃必須要有有經(jīng)驗的專業(yè)漁民的參與，因為他們擁有捕撈、運輸魚類的技術(shù)和必要的設(shè)備以及器具。
由于捕魚和生物操縱對魚類群落的生物和物理化學(xué)影響是不斷變化的，因此，對湖泊治理進行實時、連續(xù)監(jiān)測也很重要，這樣，管理者可以根據(jù)管理目標(biāo)的狀態(tài)來不斷調(diào)整管理策略， 以找到合適的方法進行湖泊治理的恢復(fù)與管理。
